第一杀手夜少空厌倦了杀手的生活，隐退到一所男子高中。却被身为同行的少女杀手作为目标，对方竟然为此女扮男装来到自己的学校...为了查清到底是谁雇佣这个杀手，夜少空开始了与少女同桌的校园生活。